政府初步建議面積約1,000公頃的交椅洲人工島由三個島嶼組成，土木工程拓展署表示，當局將會預留寬闊的水道，以避免填海工程影響鄰近島嶼沿岸具高生態價值的石珊瑚。

土拓展署署長方學誠在東涌舉辦的交椅洲人工島展覽上說，2021年底展開為期12個月的生態調查顯示，交椅洲、小交椅洲和周公島等島嶼沿岸淺水地帶有生態敏感度較高的石珊瑚群組，當局因此建議島嶼間預留闊約200米的水道，讓四周水流維持現有狀態，務求對附近環境影響降至最低。

公眾參與方面，方學誠指，政府在不同地點舉辦的主題展覽至今錄得約9,000人次參觀，另收到200多個來自網頁、電郵、傳真或郵寄的公眾意見，目前仍在整理以作全面分析。